En el viaje de regreso a casa de ToeJam y Earl, una serie de terrícolas pidieron un aventón en su nave espacial y ahora infestan el planeta Funkotron. ToeJam y Earl deberán localizar a los terrícolas con el fin de capturarlos en grandes ollas y envíarlos de regreso a la Tierra en naves espaciales. También es su misión está encontrar 10 objetos queridos que pertenecen a Lamont, la "Funkapotamus" una fuente de todo el funk en el universo, para que puedan persuadirlo de volver a su funk-lleno de favoritos planeta. ToeJam y Earl deben usar sus "poderes funk," como movimiento Funk Funk y exploración para ayudar en la evasión y la captura de los terrícolas.
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